省會、膠東、魯南三大經濟圈一體化發展指導意見是《實施方案》的配套文件。文件起草主要遵循三個原則：一是政府引導、市場運作。促進資源要素自由流動、高效配置，避免政府“大包大攬”。二是優勢互補、合作共贏。引導各市發揮比較優勢，一體聯動、抱團發展，形成整體合力。三是總體謀劃、滾動實施。一體化發展是一項系統工程，需要長期堅持，要一年接著一年干，一張藍圖干到底。

主要內容明確了空間布局。

省會經濟圈包括濟南、淄博、泰安、聊城、德州、濱州、東營7市。

膠東經濟圈包括青島、煙臺、威海、濰坊、日照5市。

魯南經濟圈包括臨沂、棗莊、濟寧、菏澤4市。

明確了功能定位。省會經濟圈的定位是黃河流域生態保護和高質量發展示范區、全國動能轉換區域傳導引領區、世界文明交流互鑒新高地。膠東經濟圈的定位是全國重要的航運貿易中心、金融中心和海洋生態文明示范區，世界先進水平的海洋科教核心區和現代海洋產業集聚區。魯南經濟圈的定位是鄉村振興先行區、轉型發展新高地、淮河流域經濟隆起帶。

明確了重點任務。三大經濟圈重點圍繞基礎設施互聯互通、生態環境共保聯治、產業創新協同共進、文化旅游融合發展、對外開放攜手共贏、要素資源高效配置、社會事業共建共享等，確定了年度重點任務。

明確了推進機制。省會經濟圈、膠東經濟圈分別由濟南市、青島市牽頭建立議事協調機構的推進機制。魯南經濟圈由四市市委書記依次輪任召集人，每次任期一年，2020年臨沂市首先輪值。